複数の動画フォルダーを登録できますか？

はい、複数登録できます。
「動画一覧1」「動画一覧2」「家族の動画」「旅行」など、目的別にフォルダーを作って登録することもできます。登録した各フォルダーの動画は、ムービーシェルフの1つの一覧にまとめて表示されます。